Сразу после открытия Емельяново практически все самолёты, базировавшиеся в Красноярске, оставались жить в Северном. Там выполнялись тяжёлые формы, была лаборатория АиРЭО и много чего ещё. Переезжало всё это хозяйство в Емельяново долго и трудно, а завод 67 ГА так и не переехал (правда, для него здание строили в Черемшанке, строительство замомрозили в 90-х, так всё и стоит).
По поводу того, что базировалось - перечислить трудно. Были Ил-14, Ил-18, Ил-76, Ту-154, Як-40, Л-410, Ан-2, Ан-12, Ан-24. Ил-86 появились только в Емельяново, про Ил-62 и Ан-26 не уверен.
Никогда не базировались (но бывали пролётом) Ту-104, Ту-124, Ту-134, Ан-10, Як-42 (хотя готовились к получению). По вертолётам - вопрос открытый.