Сама идея тупого взлома существуещего софта с целью его использования - это точно не в авиации. Никто на это не пойдет, ну или до первой катастрофы. Уж если оно настолько впилось, то тут скорее речь может идти о глубокой аналитике самих систем с полным раскрытием интерфейсов, и созданием собственных средств разработки, используя которые, уже писать свой собственный софт, который можно будет обновлять, развивать, и т.д. Но это весьма дорогое удовольствие, которое, скорее всего, просто не имеет экономического смысла.